Trong kỳ thi tuyển sinh Sau Đại học đợt 1 năm 2018 diễn ra từ ngày 24 – 25/3/2018, trường Đại học Bách Khoa có 267 thí sinh đăng ký dự thi Cao học vào 38 chuyên ngành và 08 thí sinh dự thi Nghiên cứu sinh. Ngoài ra, còn có 106 thí sinh nộp hồ sơ xét miễn thi cao học và chỉ phải thi môn Anh văn, đây là các sinh viên tốt nghiệp loại Xuất sắc, Giỏi.

Được biết trường Đại học Bách Khoa tổ chức 2 kỳ thi tuyển sinh Sau Đại học, đợt 1 vào tháng 5 và đợt 2 vào tháng 10 hằng năm. Đặc biệt, từ năm 2015, nhà trường bắt đầu triển khai việc đăng ký dự thi tuyển sinh sau đại học trực tuyến qua cổng thông tin đào tạo Sau Đại học của trường www.pgs.hcmut.edu.vn

Hiện nay, trường Đại học Bách Khoa đào tạo 38 ngành thuộc chương trình Thạc sĩ, hàng năm tuyển khoảng 1.000 học viên. Chương trình đào tạo thạc sĩ được thiết kế trên 2 hình thức (hình thức nghiên cứu - research và hình thức ứng dụng - coursework). Để được tham gia khóa đào tạo Thạc sĩ tại trường, học viên phải đạt yêu cầu của kỳ thi tuyển sinh được tổ chức 2 lần trong một năm. Trình độ Anh văn cần thiết là TOEFL ITP 450, TOEFL iBT 45, TOEIC 500 and IELTS 5,0 hoặc trình độ tương đương. Thời gian học dao động từ 1,5 đến 2 năm tùy theo chương trình Đại học của học viên. Chương trình học tương đương 45 đến 60 tín chỉ, trong đó học viên phải trải qua các môn học cũng như bảo vệ thành công khóa luận tốt nghiệp hay luận văn tốt nghiệp.

Nhà trường cũng có 29 ngành đào tạo Tiến sĩ (Doctor of Philosophy). Yêu cầu của chương trình đào tạo Tiến sĩ là các ứng viên phải đạt yêu cầu kỳ thi tuyển sinh được tổ chức 2 lần trong một năm cùng với trình độ Anh văn  TOEFL ITP 500, TOEFL iBT 61, TOEIC 600, IELTS 5,5 hoặc trình độ tương đương. Để tốt nghiệp, nghiên cứu sinh phải hoàn tất luận văn trong khoảng thời gian tối thiểu 3 năm nghiên cứu tập trung. Luận văn phải được bảo vệ thành công trước các hội đồng khoa học.