Trung tâm Quan trắc môi trường miền Nam là đơn vị sự nghiệp công lập được thành lập theo Quyết định số 1311/QĐ-BTNMT ngày 26/4/2018 của Bộ trưởng Bộ Tài nguyên và Môi trường, trực thuộc Tổng cục Môi trường, có chức năng quan trắc môi trường, đánh giá chất lượng môi trường và thực hiện các hoạt động dịch vụ trong lĩnh vực môi trường theo quy định của pháp luật trên phạm vi địa bàn 21 tỉnh, thành phố: Ninh Thuận, Bình Thuận, Bình Phước, Tây Ninh, Bình Dương, Đồng Nai, Bà Rịa - Vũng Tàu, Long An, Tiền Giang, Bến Tre, Vĩnh Long, Trà Vinh, Đồng Tháp, TP. Cần Thơ, An Giang, Kiên Giang, Hậu Giang, Sóc Trăng, Bạc Liêu, Cà Mau và TP. Hồ Chí Minh.