Trung tâm Kiểm chuẩn chất lượng xét nghiệm y học ra đời vì mục tiêu chung của ngành Y tế là nâng cao chất lượng xét nghiệm, đưa hoạt động kiểm chuẩn chất lượng xét nghiệm đến từng đơn vị thực hiện công tác xét nghiệm qua đó giúp cho kết quả xét nghiệm giảm thiểu sai sót và được thừa nhận - liên thông giữa các cơ sở y tế trong và ngoài nước, hỗ trợ trong công tác chẩn đoán và điều trị lâm sàng, nhằm tiết kiệm tối đa thời gian, tiền bạc cho xã hội và bảo vệ sức khỏe người dân.