Trung tâm Kiểm nghiệm Dược phẩm - Mỹ phẩm - Thực phẩm - Thiết bị y tế tỉnh Hậu Giang là đơn vị sự nghiệp y tế công lập trực thuộc Sở Y tế, chịu sự quản lý của Giám đốc Sở Y tế và chịu sự chỉ đạo, kiểm tra, thanh tra hướng dẫn về chuyên môn, nghiệp vụ của Viện Kiểm nghiệm thuốc Trung ương, Viện Kiểm nghiệm an toàn vệ sinh thực phẩm Quốc gia, Cục Quản lý dược, Cục An toàn thực phẩm, Vụ Trang thiết bị và Công trình y tế Bộ Y tế.