Viện Đổi mới công nghệ Thủy lợi Mekong được thành lập bởi Liên Hiệp các Hội Khoa học và Kỹ thuật Việt nam (VUSTA) có nhiệm vụ nghiên cứu đổi mới công nghệ trong lĩnh vực Thủy lợi, Công nghệ nước và Môi trường phục vụ cho phát triển bền vững vùng châu thổ Mekong và các khu vực khác tại Việt nam. Viện Đổi mới công nghệ Thủy lợi Mekong cũng sẽ hợp tác với các cơ quan, tổ chức và các cá nhân làm công tác nghiên cứu phát triển KHCN, đào tạo và các doanh nghiệp ở Việt nam cũng như nước ngoài.