Trường Cao đẳng Y tế Phú Yên có lịch sử trên 50 năm, với tiền thân là đơn vị đào tạo cán bộ y tá phục vụ cho chiến trường kháng chiến chống Mỹ cứu nước trong những năm 60. Đến năm 1989, tỉnh Phú Khánh tách thành 2 tỉnh Phú Yên và Khánh Hoà, trường là cơ sở đào tạo cán bộ y tế cho các tuyến y tế trong tỉnh Phú Yên. Năm 1991 được UBND tỉnh Phú Yên ra quyết định thành lập trường Trung học Y tế Phú Yên. Trường không ngừng phấn đấu và phát triển mọi nguồn lực, đã có nhiều thay đổi về mục tiêu, chương trình. Tháng 2 năm 2014, trường được Bộ Giáo dục và Đào tạo ra quyết định nâng cấp thành trường Cao đẳng Y tế Phú Yên. Trường Cao đẳng Y tế Phú Yên góp phần quan trọng trong nền giáo dục Đại học nước nhà, là cơ sở đào tạo, nghiên cứu khoa học có chất lượng đạt chuẩn ASEAN nhằm cung cấp nguồn nhân lực y tế cho tỉnh Phú Yên, các tỉnh lân cận và hướng đến thị trường lao động thế giới.
