Viện Tích hợp Hệ thống (ISI) được thành lập trên cơ sở tổ chức lại Trung tâm Điện tử - Tin học và Bộ môn Công nghệ Điện tử thuộc Khoa Vô tuyến điện tử. ISI đã có hơn 15 năm hoạt động trong lĩnh vực Điện tử - Tin học - Viễn thông - Tự động hóa - Tích hợp hệ thống và tư vấn đào tạo, chuyển giao công nghệ. Nhiệm vụ chính của ISI là tập trung nghiên cứu khoa học và phát triển công nghệ, tư vấn các dịch vụ kỹ thuật về tích hợp hệ thống phục vụ nhu cầu quốc phòng, an ninh.